Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF1Q9BQI6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF1Q9BQI6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms