Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TUBA1CQ9BQE3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBA1CQ9BQE3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms