Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQB6

VKORC1, Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VKORC1Q9BQB6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VKORC1Q9BQB6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VKORC1Q9BQB6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms