Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED2Q99967 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms