Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIN3AQ96ST3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIN3AQ96ST3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms