Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
IFT140Q96RY7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
IFT140Q96RY7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
IFT140Q96RY7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
IFT140Q96RY7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
IFT140Q96RY7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms