Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP3Q96P20 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP3Q96P20 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms