Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
YTHDC1Q96MU7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms