Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC114Q96M63 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms