Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUSD3Q96L08 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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