Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DCHS1Q96JQ0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DCHS1Q96JQ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms