Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK5RAP3Q96JB5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms