Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms