Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCANQ96GW7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCANQ96GW7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms