Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BORCS6Q96GS4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BORCS6Q96GS4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms