Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL48Q96GC5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL48Q96GC5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms