Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms