Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPS3Q969F9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS3Q969F9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms