Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HLA-CQ95604 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HLA-CQ95604 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms