Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUFY2Q8WXA3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY2Q8WXA3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms