Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ZNF548Q8NEK5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ZNF548Q8NEK5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ZNF548Q8NEK5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ZNF548Q8NEK5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ZNF548Q8NEK5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF548Q8NEK5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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