Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms