Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00301Q8NCQ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC00301Q8NCQ3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms