Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HJURPQ8NCD3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HJURPQ8NCD3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms