Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STAG2Q8N3U4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms