Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS37DQ86XT2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37DQ86XT2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37DQ86XT2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37DQ86XT2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37DQ86XT2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37DQ86XT2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37DQ86XT2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37DQ86XT2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37DQ86XT2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37DQ86XT2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS37DQ86XT2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms