Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRX1Q86UT6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms