Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMC6Q7Z403 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMC6Q7Z403 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms