Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APTXQ7Z2E3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APTXQ7Z2E3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms