Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
USP53Q70EK8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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USP53Q70EK8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP53Q70EK8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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