Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPN12Q6ZSI9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAPN12Q6ZSI9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms