Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf47Q6ZRZ4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf47Q6ZRZ4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf47Q6ZRZ4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms