Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VSTM1Q6UX27 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSTM1Q6UX27 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms