Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMCO3Q6UWJ1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMCO3Q6UWJ1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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