Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCIMPQ6UWF3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCIMPQ6UWF3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms