Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAF7Q6Q0C0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF7Q6Q0C0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms