Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBA3EQ6PEY2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TUBA3EQ6PEY2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms