Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC41PQ6P2S7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms