Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGMBQ6NW40 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms