Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNP1Q6NT89 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNP1Q6NT89 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms