Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF6Q6KF10 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GDF6Q6KF10 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms