Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CHIC1Q5VXU3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CHIC1Q5VXU3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms