Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRCH2Q5VUJ6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms