Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C9orf135Q5VTT2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf135Q5VTT2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms