Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF20Q5VTR2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms