Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STRIP1Q5VSL9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRIP1Q5VSL9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms