Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EFHC1Q5JVL4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHC1Q5JVL4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms