Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC4Q5GLZ8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms