Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q56UQ5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q56UQ5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q56UQ5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms