Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC93Q567U6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC93Q567U6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms